MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 9669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022579	CAA	2	6	70	75	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022579	TCC	2	6	120	125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_022579	TTA	2	6	190	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022579	TCC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_022579	GTG	2	6	219	224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022579	TAA	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022579	AT	3	6	292	297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022579	A	7	7	313	319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022579	ACT	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022579	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022579	G	6	6	1308	1313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022579	CA	3	6	1333	1338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022579	TTCTT	2	10	1351	1360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022579	CT	3	6	1475	1480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022579	TTC	2	6	1500	1505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022579	ATT	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022579	C	9	9	1954	1962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_022579	T	8	8	1964	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022579	ATT	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022579	ATT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022579	TGA	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022579	G	6	6	2114	2119	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022579	T	6	6	2211	2216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022579	T	6	6	2286	2291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022579	TTC	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022579	CTT	2	6	2356	2361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022579	TCT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022579	CAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022579	TCA	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022579	TTG	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022579	CTG	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022579	T	7	7	2505	2511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022579	GAATA	2	10	2687	2696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022579	GA	3	6	2813	2818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022579	AC	3	6	5504	5509	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022579	T	6	6	6142	6147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022579	T	7	7	6167	6173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022579	GCA	2	6	6178	6183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022579	GA	3	6	6234	6239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022579	ATG	2	6	8366	8371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022579	GTC	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022579	TACCT	2	10	8495	8504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_022579	A	8	8	8563	8570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022579	AAT	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022579	TCC	2	6	8648	8653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_022579	AGA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022579	ATG	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022579	GCC	2	6	8818	8823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_022579	GTG	2	6	8880	8885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022579	TGAAA	2	10	8888	8897	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022579	ACTT	2	8	9097	9104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022579	T	6	6	9103	9108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022579	TGTT	2	8	9203	9210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022579	GTT	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022579	AT	3	6	10345	10350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022579	GTT	2	6	10363	10368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022579	A	7	7	10395	10401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022579	T	7	7	11188	11194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022579	AGT	2	6	11208	11213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022579	A	7	7	11235	11241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022579	T	7	7	11288	11294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022579	AATA	2	8	11308	11315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022579	AT	3	6	11333	11338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022579	ACC	2	6	11352	11357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_022579	TAA	2	6	11405	11410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022579	CAA	2	6	11438	11443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022579	A	6	6	11442	11447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022579	AAT	2	6	11451	11456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022579	GTT	2	6	11464	11469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022579	TCCC	2	8	11501	11508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_022579	T	6	6	11572	11577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022579	T	6	6	11654	11659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022579	AT	3	6	15860	15865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022579	T	6	6	17488	17493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022579	ATTT	2	8	17495	17502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022579	TGA	2	6	17616	17621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022579	TCC	2	6	17654	17659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_022579	AGG	2	6	17665	17670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022579	TTTA	2	8	17695	17702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022579	ATTTT	2	10	17744	17753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022579	T	6	6	17750	17755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022579	CCA	2	6	17756	17761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_022579	TC	3	6	17796	17801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022579	T	8	8	19933	19940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022579	TTA	2	6	19967	19972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022579	CAA	2	6	19976	19981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022579	ATTT	2	8	19990	19997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022579	TAAT	2	8	20876	20883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022579	A	6	6	20955	20960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022579	ATTT	2	8	20964	20971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022579	T	6	6	20969	20974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022579	TTCG	2	8	21011	21018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022579	GTA	2	6	21081	21086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022579	TGT	2	6	21087	21092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022579	GGA	2	6	21102	21107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022579	AT	3	6	21806	21811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022579	TGG	2	6	21927	21932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022579	AGT	2	6	21935	21940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022579	TTC	2	6	22409	22414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022579	C	6	6	22421	22426	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_022579	GCG	2	6	23258	23263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022579	ATT	2	6	23590	23595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022579	G	6	6	23600	23605	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022579	AT	3	6	23956	23961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022579	GTT	2	6	23974	23979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022579	A	7	7	24006	24012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022579	ATA	3	9	24336	24344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022579	AGT	2	6	24348	24353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022579	TGT	2	6	24368	24373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022579	TAA	2	6	24387	24392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022579	TGC	2	6	24424	24429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022579	GA	4	8	24534	24541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022579	CCT	2	6	24561	24566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_022579	T	7	7	24799	24805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022579	AGT	2	6	24819	24824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022579	A	7	7	24846	24852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022579	ATAAA	2	10	24872	24881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022579	T	6	6	24906	24911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022579	AAATT	2	10	27868	27877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022579	AGA	2	6	27935	27940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022579	AATA	2	8	28300	28307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022579	TGC	2	6	28308	28313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022579	GCA	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_022579	ATTA	2	8	28415	28422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022579	A	6	6	28437	28442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022579	G	6	6	28453	28458	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022579	TGTTT	2	10	28513	28522	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022579	CCA	2	6	28523	28528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_022579	ATA	2	6	35069	35074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022579	AAG	2	6	35144	35149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022579	ATA	2	6	35159	35164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022579	ACT	2	6	36304	36309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022579	A	6	6	36336	36341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022579	T	7	7	36396	36402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022579	AGT	2	6	36416	36421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022579	A	7	7	36443	36449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022579	T	7	7	36496	36502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022579	AATA	2	8	36516	36523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022579	AT	3	6	36541	36546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022579	ACC	2	6	36559	36564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_022579	TAA	2	6	36612	36617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022579	CAA	2	6	36645	36650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022579	A	6	6	36649	36654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022579	AAT	2	6	36658	36663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022579	GTT	2	6	36671	36676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022579	TGG	2	6	36810	36815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022579	TG	3	6	36825	36830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022579	ATT	3	9	36869	36877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022579	AT	3	6	36938	36943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022579	GAA	2	6	36956	36961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022579	CAG	2	6	37067	37072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_022579	ATT	2	6	37212	37217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_022579	TAA	2	6	40941	40946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_022579	GCT	2	6	43379	43384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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301	NC_022579	TTA	2	6	98566	98571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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